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抗體驗(yàn)證的*策略:封閉肽驗(yàn)證

更新時(shí)間:2024-01-31      點(diǎn)擊次數(shù):615

據(jù)報(bào)道,每年因劣質(zhì)抗體造成的生物和醫(yī)學(xué)研究損失約為8億美元。此外,實(shí)驗(yàn)結(jié)果不一致和抗體重復(fù)性差的后果 是無(wú)法估計(jì)的。

國(guó)際抗體驗(yàn)證工作組(IWGAV)于2016年9月發(fā)表題為《 自然方法 中 抗體驗(yàn)證的建議》的文章 ,強(qiáng)調(diào)抗體驗(yàn)證應(yīng)根據(jù)目標(biāo)蛋白的相應(yīng)應(yīng)用和背景進(jìn)行。作者提出了抗體驗(yàn)證的五個(gè)概念支柱:(i)遺傳策略,(ii)正交策略,(iii)獨(dú)立抗體策略,(iv)標(biāo)記蛋白的表達(dá),以及(v)免疫捕獲后進(jìn)行質(zhì)譜分析。多發(fā)性硬化癥)。

 

這五種方法各有其優(yōu)缺點(diǎn)以及適用條件。例如,遺傳策略通過(guò)比較細(xì)胞或組織中的相關(guān)信號(hào)來(lái)評(píng)估抗體特異性,其中使用 CRISPR-Cas9 或 RNA 干擾 (RNAi) 敲除或敲低目標(biāo)基因與野生型 (WT) 對(duì)照的信號(hào)。盡管這種方法很簡(jiǎn)單,但未能擊倒或敲除目標(biāo)基因?qū)⒋蟠髶p害該方法的實(shí)驗(yàn)可行性。

 

免疫捕獲后進(jìn)行質(zhì)譜 (MS) 的方法可以識(shí)別與純化抗體直接相互作用的蛋白質(zhì), 以及與目標(biāo)蛋白質(zhì)間接相互作用的其他蛋白質(zhì)。 然而,這種方法依賴(lài)于昂貴的科學(xué)儀器和實(shí)驗(yàn)材料。并非每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都能負(fù)擔(dān)得起這些設(shè)備。

 

在 Affinity Biotech,抗體通過(guò) 獨(dú)立抗體驗(yàn)證進(jìn)行驗(yàn)證。為此,使用幾種抗體來(lái)識(shí)別靶蛋白上的不同表位。具有最高特異性的抗體是通過(guò)包括比較和定量分析的適當(dāng)程序確定的。雖然大多數(shù)抗體的檢測(cè)應(yīng)該沒(méi)有問(wèn)題,但對(duì)于檢測(cè)特異性要求較高的抗體,特別是那些位點(diǎn)特異性的磷酸化抗體,仍然不夠。

 

結(jié)合多年的抗體研發(fā)和生產(chǎn)經(jīng)驗(yàn),Affinity Biotech采用了更合適的抗體驗(yàn)證策略: 封閉 肽驗(yàn)證。

 

封閉肽(抗原)與抗體一一對(duì)應(yīng)。 。這是最原始的材料,只有原廠(chǎng)才能提供。

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首先,我們對(duì)封閉肽進(jìn)行 MS 分析,以確保肽序列準(zhǔn)確。

在蛋白質(zhì)印跡分析中,肽會(huì)阻斷目標(biāo)抗體的信號(hào)。沒(méi)有封閉肽的泳道用作對(duì)照。封閉肽將與靶蛋白競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合位點(diǎn),從而在封閉基團(tuán)中不留下特異性條帶。

 

該策略目前用于驗(yàn)證我們的抗體。它對(duì)于磷抗體的生產(chǎn)至關(guān)重要,因?yàn)樗_保了磷抗體的位點(diǎn)特異性。換句話(huà)說(shuō),磷酸化抗體只能識(shí)別相應(yīng)位點(diǎn)的磷酸化靶蛋白。非磷酸化的目標(biāo)蛋白或其他位點(diǎn)磷酸化的目標(biāo)蛋白將不會(huì)被識(shí)別。

舉個(gè)例子。在 Phospho-MSK1 (Ser211) Antibody(貨號(hào) AF7155)的蛋白質(zhì)印跡驗(yàn)證中,泳道 1 和泳道 3 中分別添加了非磷酸化阻斷肽和磷酸化阻斷肽。 2號(hào)車(chē)道沒(méi)有被封閉。結(jié)果顯示,使用磷酸化肽封閉目標(biāo)蛋白后,沒(méi)有檢測(cè)到目的條帶。

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