快速:從樣品到 DNA 擴(kuò)增只需 30 秒。
單一清洗步驟:快速去除 PCR 污染物
有效:使用干凈的基因組 DNA 獲得良好的產(chǎn)量
免設(shè)備:無需柱、移液器或離心機(jī)
簡(jiǎn)單的工作流程:gDNA 提取的三步法
通過簡(jiǎn)單的 3 步方案提取并清潔基因組 DNA。 Dipstick DNA 提取試劑盒是一種無需設(shè)備的方案,可在 30 秒內(nèi)完成從樣品到 DNA 擴(kuò)增的過程。該試劑盒包含 100 個(gè)試紙以及提取緩沖液 (50 mL) 和洗滌緩沖液 (100 mL) 的溶液,包括足夠進(jìn)行 100 次實(shí)驗(yàn)的試劑。
Dipstick DNA 提取試劑盒是提取 DNA 和清除污染物的一種非??焖俚姆椒āK脴悠房捎糜?PCR 測(cè)定、測(cè)序和 DNA 條形碼。
該方法每個(gè)樣品的成本較低,為需要清除抑制劑的極少量 DNA 樣品提供了一種經(jīng)濟(jì)實(shí)惠、可靠的替代柱式提取方法。該方法不適用于需要提取基因組 DNA 的總 DNA 的方案。
快速:從樣品到 DNA 擴(kuò)增只需 30 秒。
單一清洗步驟:快速去除 PCR 污染物
有效:使用干凈的基因組 DNA 獲得良好的產(chǎn)量
免設(shè)備:無需柱、移液器或離心機(jī)
簡(jiǎn)單的工作流程:gDNA 提取的三步法
核酸純化用于 PCR、實(shí)時(shí)定量 PCR (qPCR) 和等溫 DNA 擴(kuò)增方法環(huán)介導(dǎo) DNA 擴(kuò)增 (LAMP) 和重組酶聚合酶擴(kuò)增 (RPA)。
推薦使用方式
將 100 μL 提取緩沖液移至 1.5 mL 管中。將 1-2 mm 3樣品添加到管中。
用小塑料杵研磨樣品,并用額外的 400 μL 提取緩沖液稀釋樣品。將量油尺在提取物中上下浸 3 次,然后在 1 mL 洗滌緩沖液中浸 5 次。丟棄洗滌緩沖液。按照以下步驟保留試紙以釋放 DNA。
將試紙浸入 20–50 µl PCR 反應(yīng)混合物中 3–15 次(總共約 10 秒)以釋放 DNA。
或者,為了儲(chǔ)存 DNA 樣本,請(qǐng)將量油尺浸入一管 TE 緩沖液中。如果需要,也可以使用分子級(jí)水來儲(chǔ)存。
局限性
與使用酶或有毒化學(xué)品的DNA 提取和固相核酸提取純化方法不同,試紙純化方法提取的 DNA 產(chǎn)量較低,并且不會(huì)顯著濃縮。這意味著該方法適合基于 PCR 的應(yīng)用,而不適合限制性酶消化或 PCR 擴(kuò)增子清理等方法。
由于試紙的捕獲體積較小,該方法不適合純化大量核酸,這意味著它不適合需要大量DNA的基因組測(cè)序等方法。對(duì)于同一樣品的多次 PCR,每次 PCR 都需要單獨(dú)的試紙。
故障排除
使用過多材料引起的 PCR 抑制是使用該技術(shù)失敗的最常見原因,其次是使用不足的材料(或含有降解 DNA 的材料)。
如果 PCR 失敗,測(cè)試每單位質(zhì)量樣品材料的一系列不同比例的提取緩沖液是有用的,以確保樣品在每種情況下都可以研磨充分。這可以通過隨后在提取緩沖液中稀釋粗提取物來從最初失敗的提取物中完成。
修改
對(duì)于極小的樣品(肉眼可見的斑點(diǎn),甚至在不放大的情況下看不見的樣品),只需 50 µL 的提取緩沖液即可用于改善浸漬并避免粗提物的過度稀釋。
對(duì)于較大的樣品,或者預(yù)期 DNA 降解或 PCR 抑制劑水平較高的樣品,也可以使用增加提取緩沖液的量來提高成功率。
額外的試紙可用于提取、洗滌更多 DNA,并將更多 DNA 從粗提物轉(zhuǎn)移到 PCR 混合物中。然而,由于洗滌緩沖液殘留,每個(gè)額外的試紙可能會(huì)稍微稀釋 PCR 混合物,并且可能需要相應(yīng)地調(diào)整 PCR 混合物。
成分
提取緩沖液(20 mM Tris-HCl、25 mM NaCl、2.5 mM EDTA、0.05% SDS、2% PVP-40、pH 8)
洗滌緩沖液(10 mM Tris-HCl,pH 8)
DNA 試紙條(濾紙、蠟)
儲(chǔ)存與穩(wěn)定性
在室溫 (18–25 °C) 下保存最多 1 年。如需長(zhǎng)期儲(chǔ)存,請(qǐng)?jiān)?4 ℃ 下儲(chǔ)存或在 –20 ℃ 下冷凍。
如果提取緩沖液被冷凍,則應(yīng)將其在盛有熱水(例如剛煮沸的水)的容器中加熱,以重新溶解任何沉淀的洗滌劑。
運(yùn)輸條件
在室溫下運(yùn)輸。